Il a été créé en Juillet 2008 après la tenue du Sommet de l’Union Africaine en Egypte.
Erigée en simple Direction générale avant cette date, la gestion de l’Eau et de l’Assainissement a été mise sous tutelle du Ministère de l’Energie et des Mines...
Une exposition, organisée par le Directeur du CNEAGR et de ses membres du bureau administratif, a eu lieu le 18 Août au Centre National de l'Eau de l'Assainissement et du Génie Rural (CNEAGR) Nanisana.